Borgå museums geologiska samling består av mineraler och stenarter från olika delar av Finland. Museets utländska prover består av både slipade och naturliga halvädelstenar, samt fossiler.
Bland Borgå museums mest kända geologiska objekt är nog delarna av stenmeteoriten som slog ner i havsviken i Bjurböle, Borgå, på kvällen den 12 mars 1899. Meteoriten är en kondrit, vilket betyder att den består av små mineralkorn och ser grynig ut. Den härstammar från asteroidbältet mellan Mars och Jupiter. Meteoriterna är mycket värdefulla forskningsobjekt eftersom de under sin tid i rymden inte utsatts för samma slags geologiska omvälvningar som vårt jordiska material och innehåller därför data som jordens stenar inte längre bär på.